Clade Ib mpox virus (MPXV) (emerging clade): Available evidence suggests exclusive human-to-human contact transmission for this virus clade. Within the last 6 weeks, outbreaks continue to be reported in DRC (2’706 clade Ia/b), Uganda (914), Burundi (121), Kenya (66), Rwanda (1), Zambia (16), Congo (12, clade Ia, Ib, and IIa/b), Tanzania (15), Malawi (33), Ethiopia (18), and South Sudan. Travel-associated cases have been reported in several countries, including recently in China and Australia. For more information, see LINK.

Clade Ia MPXV is endemic in the following countries: DRC, Central African Republic, Republic of Congo, Cameroun, Sudan. Travel-related cases have been reported in China and Ireland. Epidemiological data and phylogenetic analyses still suggest that many outbreaks of clade Ia MPXV result from zoonotic spillover with secondary human-to-human transmission. However, there is emerging evidence of increasing sustained human-to-human transmission of one lineage of clade Ia MPXV from 2024, mainly through sexual contact, in Kinshasa.

Clade IIa MPXV is endemic in West Africa with rare zoonotic spillover to humans. Since 2024, increased number of cases in adults and children reported from Côte d’Ivoire, Ghana, Guinea, and Liberia in different locations, including their capital cities. Genomic sequencing analyses suggest the occurrence of repeated zoonotic spillover events followed by limited secondary human-to-human transmission.

Clade IIb MPXV (emerging clade): Available evidence suggests exclusive human-to-human contact transmission for this virus clade. Clade IIb sub-lineage B.1 (global epidemic in 2022) is still circulating worldwide at low level. Clade IIb sub-lineages A.x are circulating in Africa and the WHO Eastern Mediterranean Region. Within the last 6 weeks, outbreaks of clade IIb sub-lineages A.2 with community transmission have been reported from West Africa with Sierra Leone particularly affected (2’698 cases). In addition, cases have been reported from Liberia (100), Ghana (80 cases), Nigeria (17), Togo (18), Côte d’Ivoire (9), Guinea (1).

Weekly trends in Africa, see also LINK.

Mpox affected countries in Africa (source dashboard WHO):

La Namibie a signalé son premier cas confirmé de rage chez un otarie à fourrure du Cap dans la lagune de Walvis Bay, marquant ainsi le premier cas connu de rage chez les mammifères marins dans le pays. L'otarie a présenté des symptômes compatibles avec la rage le 13 juin 2025 et est décédée par la suite. Ce cas fait suite à un cas similaire signalé en Afrique du Sud en juin 2024. Les autorités exhortent la population à signaler tout comportement anormal chez les otaries et à éviter tout contact avec la faune sauvage. Bien que la rage soit endémique en Namibie, où elle se transmet généralement par les morsures de chiens domestiques, son apparition chez des espèces marines est rare et soulève de nouvelles préoccupations pour la faune sauvage et la santé publique.

Suite à l'augmentation significative des cas de fièvre jaune en 2025 (voir EpiNews du 13 juin 2025), le Comité suisse d'expertise en médecine des voyages a adapté les zones à risque où la vaccination contre la fièvre jaune est recommandée. Outre les zones déjà identifiées, les recommandations révisées incluent désormais les nouvelles zones à risque suivantes:

Tous les pays:

• extension du risque pour les séjours jusqu'à 2’500m d'altitude dans tous les pays
  
• la vaccination peut être envisagée pour les régions marquées en vert sur la carte du CDC
  

Pérou: Machu Picchu et tous les chemins de l'Inca
Colombie: îles de San Andrés et Providencia, séjours dans tous les parcs nationaux (nouvelle condition d'entrée!)

Entre 2024 et 2025, la Colombie a signalé 107 cas confirmés et 46 décès, la majorité des cas ayant été recensés dans le département de Tolima. Le virus de la fièvre jaune a été confirmé chez 55 primates non humains, ce qui indique que le risque de transmission persiste.

En réponse à l'augmentation des cas de fièvre jaune, Colombie a introduit de nouvelles exigences en matière de vaccination:

• Toute personne voyageant par voie terrestre ou maritime sur le territoire colombien doit être en possession d'une carte ou d'un certificat de vaccination contre la fièvre jaune. Cette mesure s'applique à tous et couvre tous les types de transport, y compris les voitures, les bus et les bateaux.
• Les visiteurs souhaitant entrer dans tout parc national naturel en Colombie (mesure appliquée aux points d'entrée)

Au total, 504 cas confirmés d'hépatite A ont été recensés entre janvier et le 31 mai 2025 dans le pays. Parmi ceux-ci, 122 sont associés à une transmission par contact sexuel. L'épidémie a principalement touché des hommes âgés de 18 à 44 ans, en particulier des hommes ayant des rapports sexuels avec des hommes (HSH).

En outre, une deuxième épidémie a été identifiée dans les régions de l'Algarve, de l'Alentejo et de Lisbonne et de la vallée du Tage, avec une transmission associée à de mauvaises conditions sanitaires, qui a particulièrement touché la population pédiatrique.

Selon les médias, un garçon de 11 ans est décédé en Slovaquie des suites d'une méningo-encéphalite amibienne primaire, le premier cas connu dans le pays.

Les autorités soupçonnent qu'il ait contracté l'infection lors d'un cours de natation au centre thermal Vadaš à Štúrovo au début du mois (juin 2025). Le centre est actuellement fermé par mesure de précaution, dans l'attente des résultats de l'enquête.

Les médias rapportent qu'il s'agit du premier cas confirmé en Slovaquie, tandis que dix-huit cas ont été signalés en République tchèque voisine.

À la mi-juin 2025, une femme de 59 ans originaire de Barnsley, au Royaume-Uni, est décédée de la rage après avoir été griffée par un chiot au Maroc en février 2025.

Aucun cas humain de rage contractée au Royaume-Uni auprès d'animaux autres que des chauves-souris n'a été signalé depuis 1902.

À Oaxaca, une augmentation des cas de paludisme autochtone a été détectée, passant de 3 en 2023 à 11 en 2024, en plus des 88 cas importés. À l'échelle nationale, une augmentation des cas a été observée, avec 576 cas en 2024, soit une augmentation de 92,6 % par rapport à 2023. San Pedro Tapanatepec, dans l'État d'Oaxaca, est une municipalité où la transmission locale est récurrente.

L'EuroPride 2025 se tiendra du 14 au 22 juin 2025 à Lisbonne, au Portugal. L'événement devrait attirer environ 200’000 personnes, dont plus de 60 % viendront de l'étranger.

Le Centre européen de prévention et de contrôle des maladies (ECDC), le Bureau régional de l'Organisation mondiale de la santé pour l'Europe (OMS/Europe) et la Direção-Geral da Saúde (DGS) du Portugal ont publié conjointement des conseils de santé à l'intention des personnes qui assisteront à ces événements. Voir LIEN.